Bei der Behandlung orientiert sich die Krankengymnastik  an den Beschwerden und den Bewegungs-, Funktions-,bzw. Aktivitätseinschränkungen des Patienten, die bei der physiotherapeutischen Untersuchung festgestellt werden. Es werden sowohl diagnostische und auf clinical reasoning (klinische Argumentation, Schlussfolgerung, Beweisführung) basierende, wie auch pädagogische und manuelle Kompetenzen der Physiotherapeutin genutzt. Ergänzt wird die Krankengymnastik im Idealfall durch natürliche physikalische Reize (z. B. Druck, Strahlung, Wärme, Kälte) und fördert so die Eigenaktivität (koordinierte Muskelaktivität sowie die bewusste Wahrnehmung) des Patienten.